WORLD FUSION MICROBIOME SERVICES
Microbiome 解析サービスカタログ電子版
皮膚菌叢・口腔内菌叢・腸内菌叢に特化した専門的な解析サービス
-
ヒト・動物の細菌 (16s rRNA)・真菌 (ITS)
-
次世代シーケンサー利用の種レベルでのメタゲノム検査サービス
-
1検体から受け入れ
-
検体採取キットから解析までを含んだ料金設定
-
充実したデータ解析サービス
皮膚菌叢解析：S-KIN
Ｓ－KIN肌菌叢検査サービスは、肌フローラに特化したサービスです。頭から足の裏まであらゆる体の部位での検査が可能です。化粧品原材料、化粧品、医薬品、石鹸等の効果の検証だけではなく、肌に接触する素材の開発などにもご利用いただけます。
口腔内菌叢解析：COMA
COMA 口腔内細菌検査サービスは、口内フローラに特化したサービスです。歯周病菌だけではなく全身疾患との関連する菌にも着目したデータベースをご用意、治療の効果だけではなく、口腔ケア商品の開発や、食品やサプリメントの効果検証、全身疾患との関連をテーマとする研究にも役立ちます。
腸内菌叢解析：腸-KIN
腸内細菌を種レベルから解析します。弊社の皮膚菌叢検査や、口腔内細菌検査などと合わせた解析などに最適です。疾患などをターゲットとした研究にご利用いただけます。
菌叢解析には、当社の開発したMetagenome@KINを利用しています。html形式の解析結果もご利用いただけます。利用実績も国内外で多く、論文投稿のMethodologyはお問い合わせください。
菌叢検査サービスの流れ
DNA抽出から次世代シーケンサーによる解析
■増幅するプライマーは見落としが最小限に抑えられるよう、
細菌：V1からV9まで網羅したユニバーサルプライマー利用
真菌：ITSI/II Spacer領域を網羅したプライマー
種レベルでの解析においては一部のプライマー領域だけでは分類が不十分であることを確認しています。
菌種の特定
■種レベルをはじめとした各階層における菌種分類を実施
■NCBI 16S Microbial DBを中心とした配列解析からの分類
■COMAは口内細菌に特化したDBをご用意
■菌叢分類のエクセルファイルとパイチャート提供
データ解析とレポート
■群間比較の棒グラフ・有意差検定
■多様性指数算出
■PCA/PCoA/SOM等クラスター解析
■希望に応じた解析手法はオプションで対応可能
■各検体の詳細菌叢解析結果
■群間比較・有意差検定・多様性指数等結果
■レポート、エクセルファイル、HTMLによる各図表
キット送付と受け入れ
■検査内容に応じたキット送付します。
綿棒・シール・ペーパーポイント・唾液キット・採便キット
■1キットから受け入れ可能です。
多彩なオプション
■PCRによる総菌数解析
■希望に応じた追加統計解析
■その他リクエストに応じた解析
ご希望をお聞かせください
WORLD FUSION MICROBIOME SERVICES 口内フローラ
口腔内菌叢解析サービス
口内フローラ専門受託サービス
全身疾患との関連にも着目したデータベース準備
口内フローラの研究だけではなく全身疾患との関連をテーマに対応した解析にも最適です。
COMA Pro、口内細菌検査サービスは、口腔内細菌の研究用の検査キットと次世代シーケンサーによる実験およびそのデータ解析まで含めたサービスです。
■唾液収集キットまたはペーパーポイントキットを準備
■1検体から受け入れ
■口内フローラに特化し介入前後比較を実施したい、群間比較を行いたい、といった方にもお勧め
■研究用解析サービスは2種類。使用するデータベースが違います。目的に応じて選択可能
COMA PRO（研究用）
研究目的用約16000種類の細菌データベース使用・種レベルまでの詳細菌叢分類・群間比較・有意差検定・主成分分析など統計結果
COMA PRO light（研究用）
HOMD（Human Oral Microbiome Database）基準の当社独自で構築した口内フローラ専用細菌データベース利用
特定71菌種を含む約650種の口内細菌による詳細解析
口内フローラから関係性がわかる全身疾患例
COMA Clinic ・一般
歯科クリニックおよび一般向けの解析キットも準備しています。データベースはCOMA PRO lightと同じ約655菌種特定71菌種のデを利用し特定菌種に関しては信号機方式の定型レポートでリスク判定可能です。
COMA Proの利用方法
■歯周炎・インプラント歯周炎の検査
■歯周病治療前後の比較
■食品・飲料・サプリメントなど効果の検証
■治療薬効果の検証
■疾患原因細菌の特定
■口内フローラバランスの分析
■歯周病による感染症原因菌の分析
■全身疾患との関連菌解析
■各種研究テーマに合わせた分析
■動物を利用した検査
■細菌・真菌検査同時解析
COMA PCR・カスタム
P.gingivalis 、T.forsythia、 T.denticola、 P.intermedia、の4菌種、プラス F.nucleatum を含む5菌種の定量PCR解析サービスです。
さらに、特定のPCR検査キットを独自で作成したいなどの要望にもお応えしております
WORLD FUSION MICROBIOME SERVICES 肌フローラ
皮膚菌叢解析サービス
肌フローラ専門受託サービス
原材料開発・医薬品・化粧品の効果・飲料/サプリメント効果
肌接触素材開発・環境分析など様々な分野で利用されています
頭皮から足の裏まで実施可能
常在菌と肌の状態、健康や疾患の関係は、まだまだ解明されていない点も多々ありますが、皮膚からの分泌物である皮脂を餌とする常在菌の平衡状態の解明は、様々な健康状態をモニターできると考えています。また、様々な疾患に関連していることも確かです。
S-Kin Proは、肌研究を支援するキットです。皮膚の常在菌の状態をさまざまな角度から分析してレポートします。
スワブした綿棒からバクテリア（細菌）の16s-rRNA遺伝子を取り出し、次世代シーケンサーで同遺伝子配列を読み取ります。その配列をリファレンスの全バクテリアDNA配列データベースと比較して、種レベルまでの菌種同定と、各菌種に割り当てられたDNA断片の数を基に相対的なバクテリアの量を算出しています。
その後、着目菌種の含有率、多様性を算出ます。
常在菌のモニターで、医薬品、サプリメント、化粧品による効果の検証に、さらに特定の機能を持った菌の探索研究にご利用ください。動物での利用も可能です。
Before/After試験と多様性解析
表現型とのオッズ比の算出
（Staphylococcus epidermidis例）
S-KIN Proの利用方法
■常在菌に着目したいので基礎データを収集したい
■生活環境に常在菌がどのように関係するのかを知りたい
■新しい常在菌を同定したい
■特定の肌状態の人に関する菌を特定したい
■創薬に利用したい、医薬品の効果を検証したい
■化粧品やサプリメントでの効果を検証したい
■肌測定データやアンケートデータ（背景情報）と有意な菌の関係を求めたい
■顔以外の皮膚常在菌を調べたい
■動物実験に利用したい
主成分分析で寄与度の高い菌を算出
表現型との有意差検定
（Staphylococcus epidermidis例）
S-KIN 一般向けサービス
一般向けの解析キットも準備しています。アクネ菌・黄色ブドウ球菌・表皮ブドウ球菌・サーモフィルズ菌に着目した解析と肌バランスを解析し、現在の肌状態を数値化して定型レポートで返却するサービスです。
詳細はお問合せください。
オプション
■総菌数解析
■真菌解析
■追加統計解析（事前打ち合わせ要）
■動物の検査
■薬物探索
■その他リクエストに応じた解析
■アンケートやフェノタイプ毎の有意差検定や、各種■データからの総合解析の実施
WORLD FUSION MICROBIOME SERVICES 腸内菌叢
腸-KIN
腸内フローラ専門受託サービス
種レベルからの解析と次世代シーケンサーで利用する16s rRNA のvariable領域をまんべんなく網羅するユニバーサルプライマー利用で詳細のデータを取得することが可能
弊社専門の口腔内菌叢解析や肌菌叢解析と同時に実施も可能です。
バイオインフォマティクス専門の会社だからこその解析を実施しています。
NGSのデータがあるが解析できていない、時間がない、解析ツールがない、ハードウエアの問題で解析できない、解析方法が全く分からない、など弊社では解析戦略、パイプラインの提案を含めサポートします。
まずはお問い合わせください。
■細菌(16s rRNA)、真菌 (ITS) メタゲノムデータ解析
既にメタゲノム解析において多くの実績有
様々な条件下で解析にお答えします
■ホールメタゲノム解析
Shot Gunシーケンスデータからサンプルの菌叢分析と可視化
PCoA/nMDS解析を行います
■コロナウイルスゲノム解析
シーケンサデータから新型コロナウイルスのゲノム配列決定と
系統(Pangolin Lineage)の判定を行います
■インフルエンザウイルス型判定
シーケンサデータからのインフルエンザウイルスゲノム配列の決定と
HA遺伝子・NA遺伝子の亜型判定を行います
上記以外にもバイオインフォマティクス、ケモインフォマティクスを利用した解析受託、判定プログラムの開発、解析パイプラインの構築など実施しております。ご興味ある方はお気軽にお問い合わせください。